Новый метод секвенирования раскрывает скрытые механизмы иммунных сигналов

Современные методы анализа иммунных клеток позволяют глубже понять, как организм реагирует на опухоли, воспаления и терапию. Однако, до недавнего времени существовал разрыв между данными по РНК и реальным уровнем белков, что затрудняло точную оценку иммунных реакций. Исследовательская группа из Комплексного онкологического центра Сильвестра при Медицинской школе Миллера Университета Майами, совместно с коллегами из Калифорнийского университета в Сан-Франциско и Центра имени Хелен Диллер, представила инновационный метод CIPHER-seq, позволяющий одновременно измерять уровень РНК и белков в одной и той же клетке.

Метод CIPHER-seq (Cytokine Intracellular Protein High-throughput Expression with RNA sequencing) обеспечивает комплексное профилирование иммунных клеток, включая:

● анализ РНК по всему геному;
● определение белков на поверхности и внутри клетки;
● выявление цитокинов, удерживаемых внутри клетки до высвобождения.

Такой подход позволяет получить максимально полную картину иммунного ответа. В отличие от традиционных методов, CIPHER-seq не искажает данные о состоянии митохондрий и других клеточных структур.

По словам доктора Джастина Тейлора, одновременное измерение РНК и белков позволяет отслеживать иммунные реакции шаг за шагом, что закладывает основу для:

● более точной диагностики и прогнозирования эффективности иммунотерапии;
● выявления механизмов развития рака и хронических воспалительных заболеваний;
● понимания причин резистентности к лечению.

«Платформа помогает нам перейти от умозаключений к пониманию того, как на самом деле протекают иммунные реакции – в каждой клетке по отдельности», – отмечает Тейлор.

В ходе тестирования метода исследователи смогли зафиксировать хронологию активации цитокинов, таких как интерферон-гамма и фактор некроза опухоли, что открывает новые возможности для персонализированной медицины и разработки таргетных препаратов.

Источник: CIPHER-seq enables intracellular multimodal profiling of cytokine responses in single immune cells, Scientific Reports (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-44946-y